国家级科研机构

• 水灾害防御全国重点实验室

• 水资源高效利用与工程安全国家工程研究中心

   省部级科研机构

• 浅水湖泊综合治理与资源开发教育部重点实验室

• 海岸灾害及防护教育部重点实验室

• 岩土力学与堤坝工程教育部重点实验室

• 南方地区高效灌排与农业水土环境教育部重点实验室

• 水利水电工程安全教育部工程研究中心

• 疏浚技术教育部工程研究中心

• 可再生能源发电技术教育部工程研究中心

• 江苏省交通基础技术工程研究中心

• 江苏省岩土工程技术工程研究中心

• 江苏省循环经济工程中心

• 江苏省水灾害监控与决策支持系统工程中心

• 东部资源环境与持续发展研究中心

• 江苏省输配电装备技术重点实验室

• 江苏省大型工程地基基础稳定性与安全监控工程技术研究中心

• 江苏省建筑物裂缝控制工程技术研究中心

• 水利经济研究所

• 水利部水工金属结构安全检测中心

• 水利部水库移民经济研究中心

•  水利部人力资源研究院

• 水利政策法制研究与培训中心

• 江苏省水资源与可持续发展研究中心

• 江苏企业国际化发展研究基地—江苏省决策咨询基地

• 教育部城市环境与可持续发展联合研究中心

• 水利部水力发电工程重点实验室

• 水利部结构力学与水工结构工程重点实验室

• 水利部岩土工程重点实验室

• 水利部机电控制及自动化重点实验室

• 水利部河口海岸工程重点实验室

• 水利部节水园区

   国际合作科研机构

• 中德水资源研究所

•  中港水利建设3S技术应用联合实验室

• 中－荷环境岩土工程合作研究中心

• 中加瞬变流仿真与控制研究中心

• 中德海岸工程研究所

• 中美全球变化与水循环联合研究中心

• 中荷水研究中心

   市级科研机构

• 南京市土工合成材料工程研究中心

•  常州市数字化制造技术重点实验室

• 常州市输配电及节电技术重点实验室

• 常州市传感网与环境感知重点实验室

• 南通河海大学海洋与近海工程研究院

   校内主要研究机构

• 新材料新能源研究开发院

• 高等教育研究所

• 水文预报研究所

• 工程水文及水文气象研究所